Образовательный проект «Моногорода» стал первой масштабной городской программой Школы управления СКОЛКОВО (2015–2020). Заказчиком выступила НКО «Фонд развития моногородов», образовательным партнёром — РАНХиГС. В проекте участвовали 322 моногорода из 64 регионов России.
Обучение проходили команды управленцев. В их состав вошли: глава города, его заместитель, представители региональной власти, градообразующего предприятия, бизнеса (инвесторы), региональных и муниципальных институтов развития.
Программа состояла из пяти модулей. Участники изучали контексты развития российских моногородов, требования к стратегии развития, программы господдержки. Также слушатели разбирали, как привлекать инвестиции и мотивировать предпринимателей. Новые знания управленцы могли применять уже во время обучения при разработке проекта развития своего моногорода.
На программе выставлялись KPI, по которым оценивалась успешность представленной командой инициативы. Так, в 2017 году ожидалось создание 85 тысяч рабочих мест, создано — 165 тысяч, планировалось привлечение 50 млрд руб. инвестиций, привлекли — 207. Было запущено более 170 инфраструктурных проектов.
Более 80% участников оценили курс высоко. А в 2018 году бизнес-кейс «Моногорода — долгий путь трансформации» стал победителем престижного конкурса 2018 EFMD Excellence in Practice в специальной категории «Развитие экосистемы».

Проект «100 крупнейших городов» стал второй масштабной программой Школы управления СКОЛКОВО по обучению управленческих команд (2020–2021). Помимо Школы и ВЭБ.РФ, над инициативой работали: Фонд развития городов, Институт «Стрелка», НИУ ВШЭ и РЭШ.
Участниками выступили 100 крупнейших городов (кроме Москвы и Санкт-Петербурга) из 65 регионов России. В составе каждой команды — пять управленцев: мэр, его заместители, заместители главы региона, главный архитектор города. Именно они должны были стать лидерами изменений, готовыми разрабатывать и реализовывать проекты муниципального развития, а значит, менять города.
Программа включала 14 блоков, в том числе две международные стажировки и четыре онлайн-модуля. В межмодульный период команды готовили проекты развития. На консультационно-экспертных сессиях ВЭБ.РФ управленцы знакомились с инструментами господдержки, а ускорить внедрение инициатив помогала экспертная аналитика. Участники погружались в международные практики управления, разрабатывали эффективные управленческие решения, адаптировали лучшие знания.
Результатом обучения стали проекты трансформации крупнейших российских городов. Было проработано свыше 800 инициатив с предполагаемым объёмом инвестиций более 20,6 трлн руб. Через 2 года после окончания курса города сообщали о работе уже над почти двумя тысячами проектов, из которых полностью реализовано 14%.
В 2021 г. программа «100 крупнейших городов» стала победителем премии «Выдающийся проект развития» международного конкурса Ассоциации институтов развития Азии и стран Тихоокеанского региона (ADFIAP) в номинации «Экономическое развитие территорий».

«Гостеприимные города» — третья городская программа Школы управления СКОЛКОВО (2023–2024). Ключевым партнёром и заказчиком проекта выступила корпорация ВЭБ.РФ. Также среди организаторов — Минэкономразвития РФ, Институт «Стрелка» и ESG-Альянс.
Проект посвящён развитию гостеприимства в городах с высоким туристическим потенциалом. Участниками стали 211 команд из 77 регионов России и сборная Кыргызстана.
Команды городов представляли пять человек: глава муниципалитета, его заместители, представители региональных властей, ответственные за туризм муниципальные служащие и сотрудники ведущих государственных туробъектов. Начиная с пятой волны к ним присоединились представители фонда «Защитники Отечества».
Обучение делилось на пять модулей. На протяжении четырёх слушатели анализировали условия в своих городах, работали с инфраструктурой, маркетингом территорий и качеством сервиса. Также управленцы изучили, как привлечь дополнительную поддержку для своих инициатив, и познакомились с инструментами ВЭБ.РФ для развития городской экономики. Третий модуль был выездным и проходил в российских городах, где туризм уже стал значимой частью экономики.
За программу команды разработали 2200 проектов общей стоимостью свыше 11 трлн рублей. Основные направления — проведение мероприятий, благоустройство, организация турмаршрутов и создание структур для содействия туризму.

Бизнес-акселератор «Экспортёры 2.0» — ключевой проект Школы управления СКОЛКОВО, который помогает предпринимателям выходить на внешние рынки. Программа была запущена в 2019 году в сотрудничестве с Российским экспортным центром, Московским экспортным центром и Школой экспорта РЭЦ.
За 10 потоков акселератора обучение прошли свыше 700 слушателей из более чем 45 регионов России. Из 10 участников 7 — владельцы и учредители компаний, 3 — менеджеры. По статистике, каждый четвёртый слушатель начинает заключать экспортные контракты ещё во время курса, а 70% выходят на экспорт в течение первого года после выпуска. География продаж выпускников превышает 50 стран.
На протяжении 4 месяцев слушатели создают экспортную стратегию для своего бизнеса, изучают рынки выбранных стран, развивают управленческие навыки и знакомятся с мерами господдержки экспорта. Лекции чередуются с практической работой в мини-группах и индивидуальными сессиями с куратором. Обучение построено таким образом, что новые знания можно быстро внедрить в бизнес, а соотношение теории и практики на программе оценивается как 3 к 7.
На конец 2024 года «Экспортёры 2.0» — это единственный проект Школы, участие в котором для предпринимателей софинансирует государство.

В 2018–2019 годах Школа управления СКОЛКОВО вместе с Агентством стратегических инициатив организовала обучение для лидеров изменений в социальной сфере. Программу прошли 70 слушателей из 10 российских регионов.
Команды формировались из курирующих вопросы социального развития управленцев, руководителей бюджетных учреждений, связанных с социальными услугами, и руководителей НГО.
Формат программы — 5 модулей. При поддержке 80 российских и иностранных профессоров и экспертов лидеры изменений изучали мировые и отечественные практики социальной сферы, разбирали проблемы и искали пути их решения, знакомились с кейсами успешных организаций. Команды погружались в сложности поиска ресурсов и учились выстраивать коммуникацию. Особое внимание уделялось введению новых механизмов финансирования проектов и привлечению инвестиций в соцсферу.
Важной частью обучения стала работа над проектами развития, которая начиналась с первых дней программы и не прекращалась в периоды между модулями. Каждая инициатива разрабатывалась для конкретного региона и помогала решать самые острые проблемы. Сферу, которая требует улучшения, управленцы выбирали сами.
Итогом обучения в СКОЛКОВО стал региональный проект решения социальных проблем, в также усовершенствованная система управления социальной сферой.

В 2021–2022 годах вместе с Фондом президентских грантов Школа управления СКОЛКОВО подготовила программы для обучения руководителей некоммерческих организаций.
Основные цели проекта — мотивация лидеров некоммерческого сектора, повышение их управленческих компетенций и построение профессиональных связей с инвесторами, донорами, госструктурами, а также внутри самого сообщества.
В 2021 году прошла образовательная программа NGO Management Programme для руководителей НКО и организаций социального сектора. Участниками стали 200 победителей конкурса ФПГ.
Обучение фокусировалось на трёх направлениях: изучение трендов, обмен практиками; работа со стейкхолдерами, медиапродвижение; управление командой, лидерство, мастерство презентаций. Тренды и управление слушатели изучали на очных модулях, а взаимодействие с заинтересованными сторонами и продвижение в медиа — в онлайн-формате. Очные модули участники оценили в среднем на 9 из 10.
В 2022 году программа была проведена снова. Помимо ФПГ, партнёром выступил Роспатриотцентр. Обучение продолжило заданную годом ранее тематику и длилось 4 дня. Участниками стали 200 победителей конкурса ФПГ из 54 регионов России.

Программу «Норма жизни» Школа управления СКОЛКОВО запустила в 2019 году. Своей целью проект ставил подготовку управленцев к работе в социальной сфере и сфере добровольчества. Партнёрами Школы выступили: АНО «Россия — страна возможностей», Ассоциация волонтёрских центров и Российский центр гражданского и патриотического воспитания детей и молодёжи (Роспатриотцентр).
«Норма жизни» собрала 20 региональных команд по 10 человек каждая. В их число вошли представители местной администрации, крупного бизнеса и краевого медиасообщества, региональных комитетов по делам молодёжи, руководители ресурсных центров волонтёров, НКО и бюджетных социальных учреждений.
Обучение проходило в три модуля. Слушатели изучали проектное управление, разбирались, как вовлекать волонтёров в работу соцучреждений, и знакомились с успешными практиками.
В двухмесячный период между модулями команды работали над проектами. Их основная задача — привлечь волонтёров в государственные и муниципальные социальные учреждения. Работая над проектами, слушатели разбирали проблемы, с которыми сталкиваются организации при сотрудничестве с волонтёрами, искали пути их преодоления и способы привлечения добровольцев.
Итогом обучения стали региональные проекты по вовлечению волонтёров и стандарт добровольной сертификации для социальных организаций.